Համաճարակի սկզբից ի վեր ախտորոշիչ թեստավորումը կենսական դեր է խաղացել SARS-CoV-2-ի՝ վիրուսի տարածումը վերահսկելու գործում, որն առաջացնում է.COVID 19.Արագ հակագենային թեստերտնային պայմաններում կամ կլինիկական պայմաններում կատարվող արդյունքներն ապահովում են 15 րոպեի ընթացքում կամ ավելի քիչ:Որքան շուտ ախտորոշվի մարդու մոտ, այնքան ավելի շուտ նա կարող է դիմել բժշկի և մեկուսացնել իրեն ուրիշներից:Բայց երբ վիրուսի նոր տարբերակներ են հայտնվում, այդ տարբերակները կարող են չհայտնաբերվել այս թեստերի միջոցով:
Հակագենային արագ թեստերի մեծ մասը նախատեսված է SARS-CoV-2 նուկլեոկապսիդային սպիտակուցը կամ N-սպիտակուցը հայտնաբերելու համար:Այս սպիտակուցը առատորեն հանդիպում է վիրուսային մասնիկների և վարակված մարդկանց մեջ:Արագ փորձարկման հավաքածուs-ը սովորաբար պարունակում է երկու տարբեր ախտորոշիչ հակամարմիններ, որոնք կապում են N սպիտակուցի տարբեր մասերին:Երբ հակամարմինը միանում է նմուշի N սպիտակուցին, փորձարկման հավաքածուի վրա հայտնվում է գունավոր գիծ կամ այլ ազդանշան, որը ցույց է տալիս վարակի առկայությունը:
Protein N-ը բաղկացած է 419 ամինաթթուների կառուցվածքային միավորներից։Դրանցից ցանկացածը մուտացիայով կարող է փոխարինվել մեկ այլ ամինաթթուով։Հետազոտական ​​խումբը ղեկավարում էր բ.գ.թ.Էմորի համալսարանից Ֆիլիպ Ֆրանկը և Էրիկ Օրթլունդը ձեռնամուխ եղան հետազոտելու, թե ինչպես է ամինաթթվի այս մեկ փոփոխությունն ազդում արագ հակագենային թեստի կատարման վրա:Նրանք օգտագործեցին մի տեխնիկա, որը կոչվում է խորը մուտացիաների սկանավորում՝ միաժամանակ գնահատելու համար, թե ինչպես է վիրուսի N սպիտակուցի յուրաքանչյուր մուտացիա ազդում ախտորոշիչ հակամարմինների հետ կապվելու վրա:Դրանց արդյունքները հրապարակվել են Cell-ում 2022 թվականի սեպտեմբերի 15-ին։
Հետազոտողները ստեղծել են մոտ 8000 N սպիտակուցի մուտացիաների համապարփակ գրադարան:Այս տարբերակները կազմում են բոլոր հնարավոր մուտացիաների ավելի քան 99,5%-ը:Նրանք այնուհետև գնահատեցին, թե ինչպես է յուրաքանչյուր տարբերակ փոխազդում 17 տարբեր ախտորոշիչ հակամարմինների հետ, որոնք օգտագործվում են առևտրային հասանելի 11 արագ հակագենային թեստերում, ներառյալ սովորականտնային փաթեթներ.
Թիմը գնահատել է, թե որ N-սպիտակուցային մուտացիաներն են ազդում հակամարմինների ճանաչման վրա:Այս տեղեկատվության հիման վրա նրանք ստեղծել են «փախուստի մուտացիայի պրոֆիլ» յուրաքանչյուր ախտորոշիչ հակամարմինի համար:Այս պրոֆիլը բացահայտում է N սպիտակուցի հատուկ մուտացիաները, որոնք կարող են ազդել հակամարմինների՝ իր թիրախին միանալու ունակության վրա:Վերլուծությունը ցույց տվեց, որ այսօրվա արագ թեստերում օգտագործվող հակամարմինները ճանաչում և կապում են SARS-CoV-2-ի բոլոր նախկին և ներկա տարբերակները, որոնք մտահոգում և մտահոգում են:
Թեև մի քանի ախտորոշիչ հակամարմիններ ճանաչում են N սպիտակուցի միևնույն շրջանը, հետազոտողները պարզել են, որ յուրաքանչյուր հակամարմին ունի փախուստի մուտացիաների յուրահատուկ նշան:Քանի որ SARS-CoV-2 վիրուսը շարունակում է մուտացիայի ենթարկվել և առաջացնել նոր տարբերակներ, այս տվյալները կարող են օգտագործվել թեստային հավաքածուի հակամարմինները նշելու համար, որոնք կարող են վերագնահատման կարիք ունենալ:
«Վարակված անհատների ճշգրիտ և արդյունավետ նույնականացումը մնում է COVID-19-ի մեղմացման կարևոր ռազմավարություն, և մեր ուսումնասիրությունը տեղեկատվություն է տրամադրում ապագա SARS-CoV-2 մուտացիաների մասին, որոնք կարող են խանգարել հայտնաբերմանը», - ասաց Օրթլունդը:«Այստեղ նկարագրված արդյունքները թույլ են տալիս մեզ արագ հարմարվել այս վիրուսին, քանի որ նոր տարբերակները շարունակում են ի հայտ գալ՝ ներկայացնելով անմիջական կլինիկական և հանրային առողջության հետևանքներ»:
Նախապատմություն. Մուտացիայի խորը սկանավորումը հայտնաբերում է SARS-CoV-2 նուկլեոկապսիդի փախուստի մուտացիաները՝ օգտագործելով ներկայումս հասանելի արագ հակագենային թեստերը:Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA բջիջ:2022 սեպտեմբերի 15; 185 (19): 3603-3616.e13.ՆԳՆ՝ 10.1016/j.cell.2022.08.010թ.2022 թվականի օգոստոսի 29 PMID՝ 36084631:
Ֆինանսավորում՝ Կենսաբժշկական պատկերավորման և կենսաճարտարագիտության ազգային ինստիտուտ NIH (NIBIB), Շաքարախտի, մարսողական և երիկամների հիվանդությունների ազգային ինստիտուտ (NIDDK) և Ալերգիայի և վարակիչ հիվանդությունների ազգային ինստիտուտ (NIAID), Սրտի ամերիկյան ասոցիացիա:
NIH Research Matters-ը NIH հետազոտության հիմնական արդյունքների շաբաթական թարմացումն է, որը վերանայվում է NIH փորձագետների կողմից:Այն հրապարակում է Առողջապահության ազգային ինստիտուտի տնօրենի հաղորդակցության և հասարակայնության հետ կապերի գրասենյակը։